صدر عن حضرة صاحب الجلالة الملك حمد بن عيسى آل خليفة عاهل البلاد المفدى أمر ملكي رقم 13 لسنة 2012 بتعيين مستشار للشؤون السياسية والاقتصادية بديوان صاحب السمو الملكي ولي العهد. وجاء في الأمر الملكي انه يعين الشيخ محمد بن عيسى بن محمد آل خليفة مستشارا للشئون السياسية والاقتصادية بديوان صاحب السمو الملكي ولي العهد.
كما جاء في الأمر الملكي انه على صاحب السمو الملكي ولي العهد نائب القائد الأعلى لقوة دفاع البحرين تنفيذ أمرنا هذا، ويُعمل به من تاريخ صدوره وينشر في الجريدة الرسمية.